MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 101352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009525	CCGC	2	8	48145	48152	0 %	0 %	25 %	75 %	148659802
1002	NC_009525	TCT	2	6	48190	48195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659802
1003	NC_009525	GCC	2	6	48199	48204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659802
1004	NC_009525	GGT	3	9	48215	48223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659802
1005	NC_009525	GGTC	2	8	48253	48260	0 %	25 %	50 %	25 %	148659802
1006	NC_009525	GCA	2	6	48355	48360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659802
1007	NC_009525	CGGTG	2	10	48416	48425	0 %	20 %	60 %	20 %	148659802
1008	NC_009525	ACA	2	6	48555	48560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659802
1009	NC_009525	TCATG	2	10	48562	48571	20 %	40 %	20 %	20 %	148659802
1010	NC_009525	GAG	2	6	48737	48742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659803
1011	NC_009525	CGGG	2	8	48804	48811	0 %	0 %	75 %	25 %	148659803
1012	NC_009525	CGG	3	9	48821	48829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659803
1013	NC_009525	GCAG	2	8	48877	48884	25 %	0 %	50 %	25 %	148659803
1014	NC_009525	GCG	2	6	48917	48922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659803
1015	NC_009525	CGT	2	6	48948	48953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659803
1016	NC_009525	TGG	2	6	49014	49019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659803
1017	NC_009525	TCG	2	6	49043	49048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659803
1018	NC_009525	GGC	2	6	49162	49167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659803
1019	NC_009525	TGG	2	6	49224	49229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659803
1020	NC_009525	CGC	2	6	49254	49259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659803
1021	NC_009525	CGT	2	6	49284	49289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659803
1022	NC_009525	T	6	6	49448	49453	0 %	100 %	0 %	0 %	148659803
1023	NC_009525	CGC	2	6	49716	49721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659804
1024	NC_009525	CGG	2	6	49731	49736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659804
1025	NC_009525	GTGC	2	8	49777	49784	0 %	25 %	50 %	25 %	148659804
1026	NC_009525	CGG	2	6	49818	49823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659804
1027	NC_009525	CCG	4	12	49880	49891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659804
1028	NC_009525	CGG	3	9	49915	49923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659804
1029	NC_009525	GCAGC	2	10	49956	49965	20 %	0 %	40 %	40 %	148659804
1030	NC_009525	GTC	2	6	49972	49977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659804
1031	NC_009525	GGC	2	6	49980	49985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659804
1032	NC_009525	TCG	2	6	50015	50020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659804
1033	NC_009525	CCCGA	2	10	50039	50048	20 %	0 %	20 %	60 %	148659804
1034	NC_009525	GCCG	2	8	50061	50068	0 %	0 %	50 %	50 %	148659804
1035	NC_009525	AGC	2	6	50105	50110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659804
1036	NC_009525	AAG	2	6	50237	50242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659804
1037	NC_009525	CGG	2	6	50285	50290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659804
1038	NC_009525	G	6	6	50316	50321	0 %	0 %	100 %	0 %	148659804
1039	NC_009525	TGC	2	6	50324	50329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659804
1040	NC_009525	GT	3	6	50406	50411	0 %	50 %	50 %	0 %	148659805
1041	NC_009525	GC	3	6	50441	50446	0 %	0 %	50 %	50 %	148659805
1042	NC_009525	CGA	2	6	50481	50486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1043	NC_009525	CGG	2	6	50526	50531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659805
1044	NC_009525	CGA	2	6	50554	50559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1045	NC_009525	GCC	2	6	50560	50565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659805
1046	NC_009525	CGT	2	6	50601	50606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1047	NC_009525	CGG	2	6	50678	50683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659805
1048	NC_009525	CGC	2	6	50697	50702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659805
1049	NC_009525	GCT	2	6	50811	50816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1050	NC_009525	CGG	2	6	50817	50822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659805
1051	NC_009525	CGA	2	6	50862	50867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1052	NC_009525	GCG	2	6	51006	51011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659805
1053	NC_009525	TCC	2	6	51023	51028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659805
1054	NC_009525	CGA	2	6	51087	51092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1055	NC_009525	CCG	3	9	51122	51130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659805
1056	NC_009525	GCC	2	6	51157	51162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659805
1057	NC_009525	CAGCG	2	10	51164	51173	20 %	0 %	40 %	40 %	148659805
1058	NC_009525	CAGC	2	8	51246	51253	25 %	0 %	25 %	50 %	148659805
1059	NC_009525	TCG	2	6	51281	51286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659805
1060	NC_009525	GAT	2	6	51385	51390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659806
1061	NC_009525	GC	5	10	51405	51414	0 %	0 %	50 %	50 %	148659806
1062	NC_009525	GTC	2	6	51418	51423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659806
1063	NC_009525	GCT	2	6	51429	51434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659806
1064	NC_009525	CGGG	2	8	51435	51442	0 %	0 %	75 %	25 %	148659806
1065	NC_009525	TCA	2	6	51447	51452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659806
1066	NC_009525	CCG	2	6	51479	51484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659806
1067	NC_009525	GCC	2	6	51509	51514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659806
1068	NC_009525	GAT	2	6	51526	51531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659806
1069	NC_009525	GCCG	2	8	51535	51542	0 %	0 %	50 %	50 %	148659806
1070	NC_009525	TCG	2	6	51638	51643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659806
1071	NC_009525	TCT	2	6	51735	51740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659806
1072	NC_009525	GCC	2	6	51787	51792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659806
1073	NC_009525	CGC	2	6	51825	51830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659806
1074	NC_009525	GGTG	2	8	51858	51865	0 %	25 %	75 %	0 %	148659806
1075	NC_009525	TCG	2	6	51867	51872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659806
1076	NC_009525	TCA	2	6	51893	51898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659806
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1079	NC_009525	TCC	2	6	52028	52033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659806
1080	NC_009525	CCT	2	6	52074	52079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659806
1081	NC_009525	GAC	2	6	52090	52095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659806
1082	NC_009525	GTA	2	6	52135	52140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659806
1083	NC_009525	GTT	2	6	52216	52221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659806
1084	NC_009525	CTT	2	6	52261	52266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659806
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1087	NC_009525	GTA	3	9	52369	52377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659806
1088	NC_009525	GCCGAC	2	12	52411	52422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148659806
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1091	NC_009525	TGC	2	6	52567	52572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659807
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1093	NC_009525	CTG	2	6	52670	52675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659807
1094	NC_009525	GGC	2	6	52722	52727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659807
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1097	NC_009525	TG	3	6	52815	52820	0 %	50 %	50 %	0 %	148659807
1098	NC_009525	CCA	2	6	52833	52838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659807
1099	NC_009525	CGT	2	6	52883	52888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659807
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1102	NC_009525	CAG	2	6	53002	53007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659807
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1104	NC_009525	ACAACG	3	18	53266	53283	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148659808
1105	NC_009525	GTG	2	6	53292	53297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659808
1106	NC_009525	CGA	2	6	53314	53319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659808
1107	NC_009525	ATG	2	6	53379	53384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659808
1108	NC_009525	GCC	2	6	53471	53476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659808
1109	NC_009525	GGTA	2	8	53479	53486	25 %	25 %	50 %	0 %	148659808
1110	NC_009525	CGG	2	6	53499	53504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659808
1111	NC_009525	CCG	2	6	53509	53514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659808
1112	NC_009525	CAG	2	6	53600	53605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659808
1113	NC_009525	CCG	2	6	53616	53621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659808
1114	NC_009525	CAC	2	6	53651	53656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659808
1115	NC_009525	CAG	2	6	53750	53755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659808
1116	NC_009525	CCA	2	6	53860	53865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659808
1117	NC_009525	TCC	2	6	53925	53930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659808
1118	NC_009525	CGT	2	6	53956	53961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659808
1119	NC_009525	CG	3	6	54022	54027	0 %	0 %	50 %	50 %	148659808
1120	NC_009525	CTG	2	6	54216	54221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659809
1121	NC_009525	GT	3	6	54247	54252	0 %	50 %	50 %	0 %	148659809
1122	NC_009525	CTG	2	6	54279	54284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659809
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1124	NC_009525	AGC	2	6	54343	54348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659809
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1126	NC_009525	CCG	2	6	54409	54414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659809
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1243	NC_009525	GCC	2	6	59206	59211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659812
1244	NC_009525	TGA	2	6	59225	59230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659812
1245	NC_009525	CGACC	2	10	59579	59588	20 %	0 %	20 %	60 %	148659813
1246	NC_009525	CGA	2	6	59591	59596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659813
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1248	NC_009525	CGG	2	6	59648	59653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659813
1249	NC_009525	GTG	2	6	59730	59735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659813
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1252	NC_009525	TCG	2	6	59969	59974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659814
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1263	NC_009525	CAG	2	6	60354	60359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659814
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1288	NC_009525	GCGG	2	8	61360	61367	0 %	0 %	75 %	25 %	148659817
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1496	NC_009525	CAA	2	6	71270	71275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659824
1497	NC_009525	AC	3	6	71276	71281	50 %	0 %	0 %	50 %	148659824
1498	NC_009525	GCC	2	6	71310	71315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659824
1499	NC_009525	CGG	2	6	71335	71340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659824
1500	NC_009525	AGC	2	6	71443	71448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659824

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